针灸减肥刺激穴位，调节中枢神经系统功能，从而加速基础代谢率，改善脂肪循环，产生热量，消耗堆积的脂肪，达到减肥的目的。针灸减肥的副作用大多是医生操作水平不达标造成的，但也可以通过有效的方法避免。但在临床实践中，常见的副作用有：针头昏厥、传染病感染、内脏损伤等。
微弱针昏迷
如果没有效果，就会浪费钱，耽误时间。但这还不算太可怕。更可怕的是“意外”。针灸减肥时，腹部的针不要扎得太深，否则会伤到内脏。尤其是对于一些腹壁比较薄的女性朋友，更要注意。针灸师要有处理一些异常现象的能力，如头晕、针滞、断针等。
传染病
由于有些针灸场所没有严格遵循“一人一针一穴”的基本原则，使用后立即丢弃，也没有必要的消毒设备，导致这类针灸减肥的副作用。如果使用非一次性的针灸针，每次通过穴位时都要将针收好浸泡，然后高温高压消毒，防止传染性病毒通过针传播。
受伤的内脏
针刺不当常引起心肺等内脏损伤。银针插入人体穴位后，也可能使毛细血管破裂。如果银针在重复使用过程中没有经过高温高压充分消毒，很容易传播血液疾病。针灸减肥的专业要求很高。与其说针灸减肥是健康减肥，不如说严格规范的针灸减肥是健康减肥。
